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Google DeepMind发布AlphaGenome 2,可按细胞类型预测基因变异影响

contact@theblockbeats.org (律动BlockBeats)

动察 Beating AI 快讯,Google DeepMind 宣布推出新一代 DNA 序列模型 AlphaGenome 2,用于预测 DNA 序列及其变异如何影响特定的人类细胞类型,以帮助研究疾病在细胞层面的成因。该模型在去年发布的 AlphaGenome 基础上,将预测从较粗的组织平均值细化到单个细胞类型和细胞状态,并重新设计了模型架构。官方称,与此前最先进的模型相比,AlphaGenome 2 识别出的可改变细胞中基因表达的变异数量接近翻倍。模型在人类和小鼠的群体与单细胞数据上训练,训练数据包括超 1.07 亿个单细胞图谱,覆盖 68 种组织,可将静态细胞图谱转化为面向人类遗传学的预测引擎。

AlphaGenome 2 是条件模型,每次针对一种组织、细胞类型或细胞状态进行预测,还能在无需重新训练的情况下适配研究人员提供的新单细胞数据,并对缺失的实验数据进行推算。该模型即日起通过 AlphaGenome API 向非商业研究开放,商业研究则以受限的非公开预览形式提供。官方强调,AlphaGenome 与 AlphaGenome 2 仅供研究使用,尚未获准用于临床或诊断目的。